Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sin3aQ60520 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sin3aQ60520 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sin3aQ60520 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sin3aQ60520 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sin3aQ60520 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms