Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp13a4Q5XF90 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp13a4Q5XF90 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a4Q5XF90 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a4Q5XF90 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a4Q5XF90 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a4Q5XF90 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a4Q5XF90 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a4Q5XF90 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a4Q5XF90 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a4Q5XF90 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms