Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dnajc11Q5U458 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnajc11Q5U458 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc11Q5U458 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc11Q5U458 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms