Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med13Q5SWW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med13Q5SWW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med13Q5SWW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med13Q5SWW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms