Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
NacadQ5SWP3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
NacadQ5SWP3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
NacadQ5SWP3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NacadQ5SWP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
NacadQ5SWP3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
NacadQ5SWP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.7
NacadQ5SWP3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC44.33■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
NacadQ5SWP3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
NacadQ5SWP3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NacadQ5SWP3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
NacadQ5SWP3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
NacadQ5SWP3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NacadQ5SWP3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NacadQ5SWP3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NacadQ5SWP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NacadQ5SWP3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NacadQ5SWP3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NacadQ5SWP3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NacadQ5SWP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NacadQ5SWP3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
NacadQ5SWP3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
NacadQ5SWP3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
NacadQ5SWP3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms