Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Ggnbp2Q5SV77 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ggnbp2Q5SV77 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ggnbp2Q5SV77 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ggnbp2Q5SV77 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ggnbp2Q5SV77 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms