Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PfasQ5SUR0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PfasQ5SUR0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PfasQ5SUR0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PfasQ5SUR0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms