Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyfip2Q5SQX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyfip2Q5SQX6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyfip2Q5SQX6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyfip2Q5SQX6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms