Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna2d4Q5RJF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna2d4Q5RJF7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d4Q5RJF7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms