Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlha9Q5RJB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlha9Q5RJB0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlha9Q5RJB0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms