Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttf2Q5NC05 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttf2Q5NC05 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttf2Q5NC05 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttf2Q5NC05 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms