Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp28Q5I043 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp28Q5I043 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp28Q5I043 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp28Q5I043 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp28Q5I043 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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