Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlrc3Q5DU56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc3Q5DU56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc3Q5DU56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc3Q5DU56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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