Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp22Q5DU02 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp22Q5DU02 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp22Q5DU02 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms