Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chsy3Q5DTK1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chsy3Q5DTK1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy3Q5DTK1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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