Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp13Q5BKP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp13Q5BKP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp13Q5BKP2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp13Q5BKP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms