Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53i11Q4QQM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trp53i11Q4QQM4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms