Protein–RNA interactions for Protein: Q497P9

Gm5941, MCG112829, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5941Q497P9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5941Q497P9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5941Q497P9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm5941Q497P9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm5941Q497P9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm5941Q497P9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms