Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt35Q497I4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt35Q497I4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt35Q497I4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt35Q497I4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt35Q497I4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt35Q497I4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt35Q497I4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt35Q497I4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt35Q497I4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms