Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Carmil2Q3V3V9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil2Q3V3V9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Carmil2Q3V3V9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms