Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms