Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmub2Q3V209 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmub2Q3V209 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmub2Q3V209 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmub2Q3V209 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms