Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd53Q3V0J4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd53Q3V0J4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd53Q3V0J4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ankrd53Q3V0J4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms