Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ankrd42Q3V096 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ankrd42Q3V096 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd42Q3V096 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms