Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc9Q3V038 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc9Q3V038 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc9Q3V038 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms