Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc114Q3UX62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc114Q3UX62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc114Q3UX62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc114Q3UX62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc114Q3UX62 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc114Q3UX62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc114Q3UX62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc114Q3UX62 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms