Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trat1Q3UU67 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trat1Q3UU67 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trat1Q3UU67 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trat1Q3UU67 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trat1Q3UU67 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trat1Q3UU67 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trat1Q3UU67 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trat1Q3UU67 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms