Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan4fQ3URS2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan4fQ3URS2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zscan4fQ3URS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zscan4fQ3URS2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms