Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam83fQ3UKU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam83fQ3UKU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam83fQ3UKU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam83fQ3UKU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam83fQ3UKU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms