Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ceacam5Q3UKK2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ceacam5Q3UKK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ceacam5Q3UKK2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ceacam5Q3UKK2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms