Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc61Q3UJV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc61Q3UJV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc61Q3UJV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc61Q3UJV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms