Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Mtcl1Q3UHU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Mtcl1Q3UHU5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Mtcl1Q3UHU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtcl1Q3UHU5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Mtcl1Q3UHU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Mtcl1Q3UHU5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Mtcl1Q3UHU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Mtcl1Q3UHU5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Mtcl1Q3UHU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms