Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndst1Q3UHN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndst1Q3UHN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndst1Q3UHN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndst1Q3UHN9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms