Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmed8Q3UHI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmed8Q3UHI4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmed8Q3UHI4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmed8Q3UHI4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmed8Q3UHI4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmed8Q3UHI4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms