Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp36Q3UFY0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp36Q3UFY0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp36Q3UFY0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp36Q3UFY0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms