Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Carmil3Q3UFQ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Carmil3Q3UFQ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Carmil3Q3UFQ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil3Q3UFQ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Carmil3Q3UFQ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Carmil3Q3UFQ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Carmil3Q3UFQ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil3Q3UFQ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Carmil3Q3UFQ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms