Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U7U4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3U7U4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U7U4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U7U4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U7U4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U7U4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U7U4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U7U4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U7U4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms