Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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