Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kdm4dQ3U2K5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kdm4dQ3U2K5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm4dQ3U2K5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms