Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf6Q3TWW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Srsf6Q3TWW8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srsf6Q3TWW8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srsf6Q3TWW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Srsf6Q3TWW8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srsf6Q3TWW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms