Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3TTL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTL0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3TTL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3TTL0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3TTL0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3TTL0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTL0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3TTL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms