Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21440Q3TTD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21440Q3TTD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21440Q3TTD8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms