Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc102aQ3TMW1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc102aQ3TMW1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms