Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc69Q3TCJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms