Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hs1bp3Q3TC93 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hs1bp3Q3TC93 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hs1bp3Q3TC93 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hs1bp3Q3TC93 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hs1bp3Q3TC93 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms