Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Prr27Q3SYJ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prr27Q3SYJ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms