Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
V1rd19Q3KNP5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
V1rd19Q3KNP5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms