Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KncnQ307W7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KncnQ307W7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KncnQ307W7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KncnQ307W7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms