Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trpm1Q2TV84 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Trpm1Q2TV84 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trpm1Q2TV84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Trpm1Q2TV84 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Trpm1Q2TV84 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Trpm1Q2TV84 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trpm1Q2TV84 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms