Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27,79■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Chrna5Q2MKA5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Chrna5Q2MKA5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Chrna5Q2MKA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chrna5Q2MKA5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27,57■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27,52■■■□□ 2
Chrna5Q2MKA5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Chrna5Q2MKA5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,5 ms