Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Gli2Q0VGT2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gli2Q0VGT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Gli2Q0VGT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gli2Q0VGT2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gli2Q0VGT2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gli2Q0VGT2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gli2Q0VGT2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms